理事会职责为：批准管理制度;批准成员单位的加入、审查和批准技术开发计划;决定项目立项、实施方案、预算、资金计划、验收等事项;决定经费的筹措、使用事项;决定技术成果的推广及收益分配方案;其他重大问题决策。

　　专家委员会职责为：为理事会的决策提供咨询、建议意见;提出技术发展方向与重点工作方向，指导秘书处制定技术发展计划;参加项目的论证、评审、实施、招标、检查、验收、提出建议、咨询意见;其他重大决策咨询。

　　秘书处职责为：组织制订管理制度;组织制定技术发展计划，拟定具体的开发项目;组织联盟有关成员签订具体的项目协议;对项目协议的执行情况进行全程监控和协调，组织对项目成果的验收;对项目的立项、知识产权归属、成果推广等事项进行管理;负责日常工作。秘书处实行专职化，下设办公室、项目部、国际部等三个部门。